Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CA9Q16790 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CA9Q16790 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CA9Q16790 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CA9Q16790 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CA9Q16790 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CA9Q16790 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CA9Q16790 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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