Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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