Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP2B3Q16720 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2B3Q16720 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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