Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A3Q16572 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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