Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms