Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms