Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN1Q14699 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms