Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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APOFQ13790 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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