Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms