Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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FOXE3Q13461 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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FOXE3Q13461 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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