Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 ITIH1-201ENST00000273283 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PFKM-202ENST00000340802 3176 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 MYT1L-204ENST00000428368 4850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 DNAJA4-201ENST00000343789 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AL359641.1-201ENST00000412509 1558 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AC092802.1-201ENST00000421762 2447 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 SLCO2B1-204ENST00000454962 3219 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 KLF11-206ENST00000540845 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 FOSB-206ENST00000586615 3774 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 NUAK2-201ENST00000367157 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 RAB7B-201ENST00000617070 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 GOLGA8F-201ENST00000526619 5237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 LINC01634-201ENST00000443243 2379 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 IFT22-211ENST00000621899 2272 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 TP53-222ENST00000617185 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UBE2V1Q13404 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms