Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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