Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms