Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RLFQ13129 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RLFQ13129 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RLFQ13129 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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