Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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TRIM32Q13049 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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TRIM32Q13049 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM32Q13049 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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