Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms