Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms