Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms