Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms