Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms