Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms