Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB4BP68371 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms