Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2BP67870 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.5 ms