Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms