Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 528.5 ms