Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVS71-1P61550 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms