Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIRAP54198 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIRAP54198 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIRAP54198 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIRAP54198 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIRAP54198 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIRAP54198 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIRAP54198 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIRAP54198 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIRAP54198 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIRAP54198 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIRAP54198 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIRAP54198 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIRAP54198 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIRAP54198 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIRAP54198 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIRAP54198 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIRAP54198 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms