Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms