Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MLH1P40692 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MLH1P40692 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MLH1P40692 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MLH1P40692 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MLH1P40692 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MLH1P40692 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MLH1P40692 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MLH1P40692 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MLH1P40692 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MLH1P40692 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MLH1P40692 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MLH1P40692 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MLH1P40692 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MLH1P40692 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MLH1P40692 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MLH1P40692 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MLH1P40692 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MLH1P40692 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MLH1P40692 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MLH1P40692 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MLH1P40692 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms