Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GJC1P36383 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GJC1P36383 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GJC1P36383 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms