Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT9P35527 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT9P35527 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT9P35527 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT9P35527 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT9P35527 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT9P35527 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT9P35527 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT9P35527 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT9P35527 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT9P35527 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT9P35527 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT9P35527 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT9P35527 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT9P35527 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT9P35527 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT9P35527 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT9P35527 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms