Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB2P29033 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB2P29033 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJB2P29033 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJB2P29033 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJB2P29033 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJB2P29033 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GJB2P29033 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms