Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLD1P28340 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms