Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms