Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms