Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms