Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms