Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AMD1P17707 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AMD1P17707 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AMD1P17707 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AMD1P17707 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMD1P17707 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms