Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms