Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms