Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms