Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PCNAP12004 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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PCNAP12004 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PCNAP12004 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PCNAP12004 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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PCNAP12004 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PCNAP12004 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PCNAP12004 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PCNAP12004 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PCNAP12004 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PCNAP12004 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PCNAP12004 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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