Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLTBP09497 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLTBP09497 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLTBP09497 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLTBP09497 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLTBP09497 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLTBP09497 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLTBP09497 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLTBP09497 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLTBP09497 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLTBP09497 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLTBP09497 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLTBP09497 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLTBP09497 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLTBP09497 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms