Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYBBP04839 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms