Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJB6O95452 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJB6O95452 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJB6O95452 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJB6O95452 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJB6O95452 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms