Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CEP104O60308 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CEP104O60308 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CEP104O60308 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CEP104O60308 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CEP104O60308 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CEP104O60308 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CEP104O60308 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CEP104O60308 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEP104O60308 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms