Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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