Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms