Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms