Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms